细胞吞噬自身的细胞质蛋白或细胞器，使其包被于双层囊泡，并与溶酶体或液泡（酵母中）相融合而降解这些被包裹的内容物的过程。这样包含内容物的双层囊泡结构称为自噬体；自噬体与溶酶体（或酵母中的液泡）相融合而形成的膜泡型细胞器称为自噬溶酶体。
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